国内到香港的海关免关税进口的申请流程有：

减免税政策是国家对符合条件的企业、单位和个人而实施的一项税收优惠政策。企业、单位在享有减免税优惠待遇的同时，要珍惜这一权利，依法申请、使用、保管和处置减免税货物，并承担相应义务。

　　为方便企业、单位了解海关关于减免税货物的申办和监管要求，加强内部管理，对有关事项告知如下：

　　（一）申请流程:申请单位项目备案预录－海关项目备案审核－申请单位减免税审批预录－海关减免税审批－海关出具《进出口货物征免税证明》－报关进口。

　　减免税备案、减免税审批和减免税后续管理中的相关审批事项实行三级审批作业制度。

　　（二）申请时限：除另有规定外，项目单位应在货物进出口15天前，持齐全有效单证向海关申请办理进出口货物减免税审批手续。

　　（三）受理时限: 海关受理备案申请和减免税审批申请，在单证齐全有效和电脑数据无疑义的情况下，应分别在受理之日起5个工作日内完成，如果该申请须由所在地主管海关上报直属海关审批，直属海关在接到有效的单证及电脑数据之日起5个工作日内做出批复。特殊情况除外。

　　（四）申请材料: 减免税项目备案、审批所需单证，详见附件。

　　（五）减免税备案手续

　　1项目单位在申请办理进出口货物减免税审批手续之前，应当向主管海关申请进行减免税备案。海关对申请享受减免税优惠政策的项目单位进行资格确认，对项目是否符合减免税政策要求进行审核，确定项目的减免税额度等事项。

　　2项目单位申请办理减免税备案手续时，应当填写《减免税备案申请表》，并向海关提交齐全有效的备案单证。

　　3海关对项目申请单位的主体资格和项目的资格进行形式审核。海关收到项目单位的减免税备案申请后进行审核。海关重点审核申请备案提交的单证是否齐全、有效，申请填报规范的，受理申请并自受理之日起5个工作日内作出批准或者不予批准的审批决定。申请材料不全或者不符合规定形式的，海关应当在收到申请材料之日起5个工作日内一次告之项目单位需要补正的全部内容

　　4项目单位因故需变更备案内容的，应向主管海关递交书面申请说明原因，并提交按规定需项目审批部门出具的意见，经海关审核后予以办理变更手续。

　　项目单位因故需撤销或停止执行的减免税项目，应向主管海关递交书面申请说明原因，并提交按规定需项目审批部门出具的意见，经海关审核后予以办理作废手续。

　　（六）进出口货物减免税审批手续

　　1项目单位应当在货物进出口前，填写《进出口货物征免税申请表》，并持齐全有效单证向主管海关申请办理进出口货物减免税审批手续。未在货物进出口前向海关申请办理减免税审批手续，视作自动放弃其有关货物的减免税资格，海关应当不予办理其有关货物的减免税手续。

　　2海关在受理进出口货物减免税手续前，审核所提交单证是否齐全、有效，各项数据填报是否规范，项目资金来源是否影响减免税货物的所有权。

　　海关受理项目单位申请后，审核申请减免税货物是否符合国家税收优惠政策规定，是否为不予免税商品，是否在减免税额度内，经审核无误后予以签发《征免税证明》，除另有规定外，有效期不超过半年。

　　3项目单位因故需变更已签发的《征免税证明》中可直接变更的栏目的，应当向主管海关提出书面申请，海关审核同意后予以变更；

　　因故需变更其他栏目或作废已签发的《征免税证明》的，应向主管海关递交书面申请，海关审核同意后予以变更或作废，并收回作废的《征免税证明》。

　　项目单位不慎遗失已签发的《征免税证明》且需重新办理的，应向主管海关递交书面申请，海关审核同意并经核实《征免税证明》的使用情况后，应及时将尚未使用的原《征免税证明》的电子数据予以作废，并重新签发《征免税证明》。

　　（七）减免税货物的税款退还和担保

　　1按照规定可予减免税的货物已征收税款的，并且项目单位在货物进出口前，按照规定持有关文件向海关办理减免税审批手续，项目单位可在货物实际进出口之日起3个月内持《征免税证明》、主管海关出具的货物进口前受理减免税审批申请的书面证明及其它有关单证向海关申请退税。

2正在海关办理减免税审批手续过程中，进出口货物已经到达港口，项目单位向海关申请先放行货物的，可凭主管海关出具的正在办理减免税审批手续的书面证明和足额税款担保向海关申请办理税款担保放行手续。税款担保期限一般不超过6个月。

　　项目单位不能提交主管海关出具的正在办理减免税审批手续的书面证明的，现场海关应当予以照章征税放行。

　　（八）减免税货物结转手续

　　项目单位因故需将海关监管年限内的进口减免税货物转让的，须事先持有关单证向海关申请办理减免税货物结转或补税手续。减免税货物结转手续按以下要求办理：

　　1转出减免税货物的项目单位事先向转出地海关提出申请，转出地海关审核同意后，由其所在的直属海关向转入地直属海关发送《某某海关减免税进口货物结转联系函》。

　　2转入减免税货物的项目单位按照办理进口货物减免税申请要求，向转入地海关申请办理转入手续。转入地海关审核无误后签发《征免税证明》，并由转入地直属海关将联系函回执联发回转出地直属海关。

　　3转出、转入减免税货物的项目单位分别向转出、转入地海关办理减免税货物的出、进口形式报关手续。

　　4转出地海关凭《某某海关减免税进口货物结转联系函》回执联和结转出口报关单办理已结转减免税货物结案手续。

　　5转出、转入地直属海关应加强联系配合，由转入地海关对结转设备继续实施后续监管。

　　除另有规定外，转出地、转入地海关分别指转出减免税货物的项目单位所在地海关和转入减免税货物的项目单位所在地海关。

　　转出地直属海关与原审批海关不是同一个直属海关的，转出地海关应及时将减免税货物结转手续办理情况书面通知原审批海关。

　　项目单位因故需将海关监管年限内的进口减免税货物转让给其他不享受减免税优惠待遇资格的项目单位，须事先向其主管海关申请办理减免税货物补缴税款和解除监管手续。

　　项目单位将其进口减免税货物转让的，其减免税额度不予恢复。设备转入的项目单位应当按照货物成交价格扣减项目减免税额度，设备监管期限连续计算。

　　（九）减免税货物贷款抵押申请手续

　　1项目单位以海关监管期内的特定减免税货物向国内外金融机构作贷款抵押的，须事先持有关单证向主管海关书面申请，经核准后方可办理贷款抵押手续。对实行配额许可证管理的特定减免税货物不得用于抵押货款地。

　　2特定减免税货物贷款抵押限于向中国境内金融机构或境外金融机构。项目单位不得以特定减免税货物向除金融机构以外的其他法人、团体或公民设定抵押。

　　境内金融机构系指在中国境内注册登记、并经主管机关批准的银行和非银行金融机构（包括信托投资公司、融资租赁公司和财务公司等）。

　　境内金融机构包括内资金融机构和外资金融机构，其中“外资金融机构”系指依照《中华人民共和国外资金融机构管理条例》，经批准在中国境内设立和营业的含有外国资本的金融机构，具体包括：总行在中国境内的外国资本的银行、外国银行在中国境内的分行、外国的金融机构同中国的公司、企业在中国境内合资经营的银行、总公司在中国境内的外国资本的财务公司、外国的金融机构同中国的公司、企业在中国境内合资经营的财务公司等。

　　3抵押贷款数额与特定减免税货物（抵押物）应缴税款之和，应当小于该特定减免税货物（抵押物）的实际价值；该特定减免税货物（抵押物）的实际价值以海关估价为准。

　　4当抵押贷款无法清偿时，需要以监管期内的特定减免税货物（抵押物）折（变）价抵偿贷款时，项目单位应先办理税款担保转税手续；已签署海关、金融机构和项目单位三方书面协议的，项目单位（抵押人）或金融机构（抵押权人）应当先从抵押物的折（变）价款中优先偿付税款后，剩余部分再清偿贷款。

　　（十）减免税货物的退运出口

　　项目单位因故需将尚在海关监管期内的减免税进口货物退运出境的，须事先持有关单证报主管海关核准。

　　货物退运出口后项目单位持凭出口报关单向主管海关办理原减免税进口货物结案手续，减免税额度不予恢复。